张子龙

教育经历

2017-04至2020-03，东京大学，博士

2010-09至2013-06，吉林大学，硕士

2006-09至2010-06，吉林大学，学士

工作经历

2022-03至今，sunbet申搏官方网站，sunbet申搏官方网站，副教授

2020-04至2022-03，电子科技大学，基础与前沿研究院，博士后

研究方向

人工智能、计算生物学、生物信息学

主要研究工作集中在开发和利用人工智能方法对于生物学、药学中的多个交叉前沿和热点问题进行探索

基本介绍

张子龙，博士，sunbet申搏官方网站副教授，博/硕士生导师，海南省“南海新星”第一批人才计划入选者，海南省D类高层次人才。中国计算机学会(CCF)生物信息学专业委员会委员，中国生物工程学会计算生物学与生物信息学(NCCBB)专业委员会委员，生物信息学与智能信息处理学术会议(BIIP)专业委员会委员，中国国家自然科学基金委(NSFC)函评专家，吴文俊人工智能科学技术奖评审专家。

获得海南省自然科学奖三等奖一项（排名第一），主持国家级自然科学基金面上项目一项、国家级自然科学基金青年项目一项（已结题）、国家级自然科学基金地区项目一项、博士后国际交流引进项目一项（已结题）、主持海南省自然科学基金面上项目一项。以第一或通讯作者在Advanced Science、Research、Nano Letters等生物信息学顶级期刊或会议发表论文多篇。受邀担任Frontiers in Genetics、Machines等SCI期刊客座编辑，担任Nature Communications、Genome Biology等著名SCI期刊审稿人。

指导本科生发表第一作者SCI或CCF论文：

23级本科生

1. Jiajing Wang, Aoyun Geng, Ziyuan Yan, Xiaomeng Lin, Yuanhao Li, Junlin Xu, Yajie Meng, Zilong Zhang, Leyi Wei, Quan Zou, Feifei Cui. FA-Amy: An amyloid protein prediction model based on protein pre-trained large models and an attention-fusion strategy. International Journal of Biological Macromolecules 2026; 335:149267. （TOP期刊、中科院大类二区，王加泾同学为2023级本科生）

2. Ziyuan Yan, Aoyun Geng, Yazi Li, Jiajing Wang, Junlin Xu, Yajie Meng, Leyi Wei, Quan Zou, Zilong Zhang, Feifei Cui. CNNCaps-DBP: Leveraging protein language models with attention-augmented convolution for DNA-binding protein prediction. Neural Networks. 2026, 195:108261. （TOP期刊、中科院大类二区，严子源同学为2023级本科生）

3. Zihang Wang, Aoyun Geng, Junlin Xu, Yajie Meng, Zilong Zhang, Leyi Wei, Quan Zou, and Feifei Cui. A comprehensive review of computational methods for predicting DNA N4-methylcytosine sites. International Journal of Biological Macromolecules, 2025: p. 148221. （TOP期刊、中科院大类二区，2023级本科生）

22级本科生

1. Jingwei Lv, Aoyun Geng, Zhuoyu Pan, Leyi Wei, Quan Zou, Zilong Zhang, Feifei Cui*. iBitter-GRE: A Novel Stacked Bitter Peptide Predictor with ESM-2 and Multi-View Features. Journal of Molecular Biology 2025, 437(8):169005. (中科院大类二区，吕经纬同学为2022级本科生)

2. Jingwei Lv, Kexin Li, Yike Wang, Junlin Xu, Yajie Meng, Feifei Cui, Leyi Wei, Qingchen Zhang and Zilong Zhang. ACP-EPC: an interpretable deep learning framework for anticancer peptide prediction utilizing pre-trained protein language model and multi-view feature extracting strategy. Molecular Diversity, 2025. (中科院大类二区，吕经纬同学为2022级本科生)

3. Yuanhao Li, Aoyun Geng, Zheyu Zhou, Feifei Cui, Junlin Xu, Yajie Meng, Leyi Wei, Quan Zou, Qingcheng Zhang, Zilong Zhang*. AVP-HNCL: Innovative Contrastive Learning with a Queue-Based Negative Sampling Strategy for Dual-Phase Antiviral Peptide Prediction. Journal of Chemical Information and Modeling 2025. (TOP期刊，李袁昊同学为2022级本科生，生态学专业)

4. Zheyu Zhou, Cuilin Xiao, Jinfen Yin, Hao Duan, Chunling Liu, Feifei Cui, Zilong Zhang*. PSAC-6mA: 6mA Site Identifier Using Self-Attention Capsule Network based on Sequence-Positioning. Computers in Biology and Medicine. (中科院小类一区，TOP期刊，周喆誉同学为2022级本科生)

21级本科生

1. Cuilin Xiao, Zheyu Zhou, Jiayi She, Jinfen Yin, Feifei Cui, Zilong Zhang*. PEL-PVP: Application of plant vacuolar protein discriminator based on PEFT ESM-2 and bilayer LSTM in an unbalanced dataset. International Journal of Biological Macromolecules 2024; 277:134317. (中科院大类一区，影响因子7.7, TOP期刊, 肖萃林同学为2021级本科生，软件工程专业)

2. Yazi Li, Xiaoman Wei, Qinglin Yang, An Xiong, Xingfeng Li, Quan Zou, Feifei Cui*, Zilong Zhang*. msBERT-Promoter: a multi-scale ensemble predictor based on BERT pre-trained model for the two-stage prediction of DNA promoters and their strengths. BMC Biology 2024; 22(1):126. (中科院大类一区，TOP期刊，李亚子同学为2021级本科生，应用数学专业)

3. Ziyi Wang, Aoyun Geng, Hao Duan, Feifei Cui, Quan Zou, Zilong Zhang*. A Comprehensive Review of Approaches for Spatial Domain Recognition of Spatial Transcriptomes. Briefings in Functional Genomics 2024, 23(6):702-712. (王梓懿同学为2021级本科生)

4. Haoye Qiu, Donglai Wang, Xiaoyang Liu, Feifei Cui, Zilong Zhang*. FCLNCM: Feature-Weight and Cluster-Weight Learning in Neutrosophic c-Means Clustering for Biomedical Applications. (审稿中，裘昊晔同学为2021级本科生)

指导本科生大创项目
基于癌症基因表达数据的自适应加权中智C-均值聚类算法研究（项目负责人：裘昊晔）

基于Diffusion的高穿膜性环肽定向生成模型（项目负责人：周喆誉）

指导本科生竞赛

1. 周喆誉等同学参赛作品《基于深度学习的生物序列预测平台》获得中国高校计算机大赛全国一等奖

2. 李亚子等同学参赛作品《大语言模型在DNA启动子识别和强度预测中的综合运用：基于两阶段微调和集成学习的可解释性方法研究》全国大学生统计建模比赛广东赛区一等奖

3. 周喆誉、颜诗雨等同学参赛作品《基于深度学习的基因调控序列特征识别与分析研究》获得全国大学生生命科学竞赛（创新创业类）全国二等奖

4. 佘嘉怡等同学参赛作品《智能细胞器与抗病肽协同预测平台》获得全国大学生生命科学竞赛（创新创业类）全国三等奖

课程教学

算法设计与分析、机器学习、自然语言处理、近代统计方法、图论及其应用、Python语言程序设计基础、人工智能通识

个人主页

http://www.bioai-lab.com/info/zhangzilong

Ø 欢迎本科期间目标发表第一作者SCI论文、并有志向将来从事科研工作的同学联系（请勿同时向多位老师群发邮件，单纯为了保研加分等短视、功利性目的的同学请勿联系）；

Ø 欢迎感兴趣报考硕士、博士的同学联系（请勿同时向多位老师群发邮件），优先考虑具有计算机、统计、数学等相关背景的同学；

Ø 课题组长期招收博士后，欢迎邮件咨询；

Ø 与英国剑桥大学、日本东京大学、沙特阿卜杜拉国王科技大学、澳大利亚莫纳什大学、电子科技大学等国内外科研院校具有良好合作关系，优秀者可推荐前往深造、访学。